关于“消防控制室消防主机有故障点能否以消防设施未保持完好有效案由处罚”应当视具体情况进行处理。

如消防控制室控制主机有故障点，但值班人员已登记并且正在维修报备，不应进行处罚。如消防控制室控制主机有故障点，未登记也未报备且长期存在，单位置之不理，是可以以消防设施未保持完好有效案由进行处罚。

因此，消防主机有故障，首先应做好记录并报备维修，且要及时处理故障信息。